Lexique

Acide aminé : Molécule constitutive des protéines. Il en existe 20 différents. Les 20 perles, chacune de couleur différente, constitutives des protéines assimilées à des colliers de perles (cf. présentation de l'étude).

ADN : Acide DésoxyriboNucléique. C’est le constituant chimique des chromosomes (et donc des gènes). Il correspond à l’enchaînement des nucléotides, au nombre de quatre et identifiés par leur initiale respective : A, G, C, et T.

Adventices : Toute plante qui croit sur un terrain cultivé sans y avoir été semé. Les adventices sont souvent désignées globalement sous le terme de « mauvaises herbes ».

ARN : Acide RiboNucléique. C’est le constituant chimique des transcrits, fabriqués à partir des gènes par le mécanisme de transcription. Il correspond à l’enchaînement de quatre nucléotides, identifiés par leur initiale respective : A, G, C, et U.

ARN messager : Molécule fabriquée (par transcription) à partir d’un gène codant une (ou des) protéine(s). Cet ARN contient le message génétique et va être lu directement par la machinerie de traduction pour fabriquer la ou les protéine(s) correspondante(s). L’ARN messager est donc une molécule intermédiaire entre un gène et la (ou les) protéine(s) qu’il code.

Biolistique : Technique utilisée pour introduire une Construction Génétique Artificielle (CGA) dans des cellules de plantes. Elle consiste, à l’aide d’un appareil appelécanon à gènes, à bombarder des cellules de plante en culture avec des microbilles (de tungstène, d’or ou de platine) d’un micron de diamètre enduites de la CGAen question. Les microbilles passent à travers les cellules, laissant éventuellement au passage une ou plusieurs CGA qui se décrochent et qui vont alors pouvoir aller s’insérer dans un ou plusieurs chromosome(s) de la plante.

Canon à gènes : Appareil utilisé dans la technique appelée biolistique pour bombarder des cellules de plante en culture avec des microbilles (de tungstène, d’or ou de platine) d’un micron de diamètre enduites de la CGA que l’on veut introduire dans ces cellules.

Cellule : Élément constitutif fondamental de tout être vivant.

Chromosome : Très longue molécule constituée de deux brins parallèles entourés l’un autour de l’autre pour former une double hélice ; chacun des deux brins est lui même constitué de l’enchaînement à la queue leu leu de quatre molécules symbolisées par quatre lettres correspondant à leur initiale respective ( A, G, C, T) : les nucléotides. Les chromosomes contiennent l’information génétique d’un organisme qui est la même dans chacune de ses cellules. Chaque organisme a, dans chacune de ses cellules, un nombre défini de chromosomes.

Construction Génétique Artificielle (CGA) : Chimère génétique constituée de fragments de gènes (de fragments de chromosomes) qui peuvent être d’origines différentes (provenir d’organismes différents). C’est cette chimère qui est introduite dans un organisme receveur pour en faire un organisme transgénique : le transgène ne correspond en fait qu’à une partie de la CGA (la séquence codante) qui peut elle-même avoir été plus ou moins modifiée.

Electroporation : Technique utilisée pour introduire une CGA dans des cellules « receveuses » (notamment des bactéries ou des cellules à l’état de protoplastes), et qui consiste à faire des trous (des pores) dans les cellules en question à l’aide d’une décharge électrique. C’est par ces pores que la CGA peut alors pénétrer dans les cellules.

Enzyme : Protéine douée d’une activité biologique particulière. Les enzymes sont en quelque sorte les catalyseurs biologiques des réactions chimiques (dites biochimiques) qui ont lieu dans les cellules de tout organisme vivant.

Enzyme de restriction : Protéine de bactérie qui possède la propriété biologique de couper la double hélice d’ADN en des endroits précis (déterminés par la séquence, c’est-à-dire l’ordre de succession des molécules correspondant aux quatre lettres A,G,C,T). De nombreuses enzymes de restriction (provenant d’une multitude de bactéries différentes) ont été purifiées et sont utilisées par les généticiens moléculaires comme des outils à leur service pour fragmenter des chromosomes ou diverses molécules d’ADN. Ce sont des outils incontournables pour notamment réaliser des CGA.

Équivalence en substance : Notion sur laquelle s’appuient les instances gouvernementales dans le Monde en matière d’évaluation des OGM, et qui revient à considérer qu’un OGM ne diffère de l’organisme conventionnel à partir duquel il a été fabriqué que par les gènes qui y ont été introduits ou modifiés.

Escherichia coli : Bactérie intestinale des mammifères (et donc de l’être humain) très utilisée en laboratoire à la fois comme modèle d’étude et comme outil. Elle est en particulier très utilisée comme éprouvette biologique dans toutes les manipulations d’ADN, et notamment pour la réalisation des diverses CGA (c’est en quelque sorte la « mascotte » des généticiens moléculaires).

Études protéomiques : Analyses qualitative et quantitative du protéome, c’est-à-dire de l’ensemble des protéines d’une cellule ou d’un organisme

Études transcriptomiques : Analyses qualitative et quantitative du transcriptome, c’est-à-dire de l’ensemble des transcrits (ARN) d’une cellule ou d’un organisme

Gène : Il n’existe pas de définition officielle (académique) du gène. Il y a presque autant de définitions du gène que de biologistes. Toute définition est donc « précaire » et amenée à évoluer avec les connaissances nouvelles acquises qui viennent régulièrement bouleverser les dogmes en place. Communément, jusqu’à aujourd’hui, on entend essentiellement par « gènes » des segments d’ADN (de chromosomes) détenant l’information qui permet à la cellule de fabriquer une ou plusieurs protéine(s).

Gène marqueur : Gène utilisé dans une construction génétique artificielle en plus du transgène d’intérêt  et qui a la particularité de conférer aux cellules qui l’hébergent (et qui hébergent donc la CGA) une propriété facilement repérable : il permet ainsi d’identifier les cellules devenues transgéniques. Le plus souvent, le gène marqueur est un gène de résistance à un antibiotique mais il peut s’agir aussi, par exemple, d’un gène de résistance à un herbicide.

Génome : Ensemble des chromosomes d’un organisme vivant.

MGM : Mico-organisme Génétiquement Modifié. Ce sont des bactéries, des levures ou des champignons filamenteux (moisissures).

Modifications post-traductionnelles : Modifications chimiques secondaires, comme l’ajout de sucres ou de phosphates, que subissent certaines protéines après la traduction, c’est-à-dire après l’enchaînement des acides aminés — des perles — et après leur repliement dans l’espace.

Mycotoxine : Toxine fabriquée et secrétée par un champignon.

Noyau : Compartiment à l’intérieur de chaque cellule (à l’exception des bactéries) qui renferme les chromosomes.

Nucléotide : Molécule constitutive de l’ADN (et donc des chromosomes et des gènes) et de l'ARN. Il en existe quatre différents identifiés par leur initiale respective : A, G, C et T pour l'ADN et A, G, C et U pour l'ARN.

Organisme transgénique : Organisme génétiquement modifié contenant au moins un gèneprovenant d’un autre organisme (transgène).

Pesticide : Toute substance destinée à tuer ce qui est considéré comme nuisible aux cultures. C’est le terme générique qui englobe les insecticides (qui tuent les insectes) les herbicides (qui tuent ce qui est appelé les « mauvaises herbes » ou adventices) et les fongicides (qui tuent les champignons)...

Promoteur : Partie d’un gène se situant en amont de la séquence codante, qui marque le début du gène sur le chromosome et qui permet sa stimulation pour qu’il soit transcrit en ARN (celle-ci est soit permanente, soit fonction d’un certain nombre de paramètres physiologiques ou de signaux extérieurs).

Protéines : Grosses molécules constituées de l’enchaînement de 20 plus petites molécules différentes appelées acides aminés — les fameuses perles (cf. présentation de l'étude)  — et dont la nature et l’ordre d’enchaînement est défini par la séquence codante du gène qui en détient le secret de fabrication. Une protéine est donc comme un grand collier de perles qui se replie dans l’espace selon une structure bien précise et propre à chaque protéine.

Protéines recombinantes : Se dit d’une protéine obtenue par transgenèse, c’est-à-dire fabriquée par un organisme différent de celui qui la fabrique naturellement, après qu’il ait reçu le gène (ou plus précisément la CGA faite à partir de ce gène) qui en détient le secret de fabrication.

Protéome : L’ensemble des protéines d’une cellule ou d’un organisme.

Protoplastes : Se dit de cellules dépourvues de la paroi dont elles sont normalement dotées (cellules de plantes, de levures, de champignons) et qui les protège, entre autres, des variations de pressions. Des protoplastes doivent donc être maintenus en condition isotonique (c’est-à-dire dans un milieu où la pression osmotique est la même que celle de l’intérieur des cellules).

Recombinaison : Mécanisme moléculaire par lequel un fragment d’ADNpeut s’insérer dans un autre ou par lequel deux fragments d’ADN peuvent s’échanger des morceaux entre eux.

Réseau métabolique : Ensemble des processus biologiques ayant lieu dans une cellule (c’est-à-dire l’ensemble des chaînes de montage et de démontage ayant lieu dans les usines cellulaires d’un organisme - cf Présentation de l'étude).

Sélection massale : Sélection qui consiste pour les agriculteurs à choisir préférentiellement leurs propres semences parmi les graines jugées comme étant les plus intéressantes, sur les épis et les plants dont la croissance, le comportement et le développement, présentent les caractéristiques les plus recherchées.

Séquençage : Technique qui consiste à déterminer l’ordre de succession des nucléotides (des quatre lettres A,G,C,T) tout le long d’une molécule d’ADN (ou sur chacun des deux brins d’un chromosome).

Séquence codante : Se dit de la partie d’un gène qui détient le secret de fabrication d’une protéine (qui est traduit en protéine).

Terminateur : Partie d’un gène se situant en aval de la séquence codante et qui marque la fin du gène sur le chromosome.

Traduction : Processus qui permet de passer d’un transcrit (ARN messager) à la protéine, c’est-à-dire du langage génétique en quatre lettres (A, G, C, U) au langage protéique en 20 lettres (les 20 perles de 20 couleur différentes ou acides aminés).

Transcrit : Molécule résultant de la transcription d’une séquence d’ADN. Il s’agit d’une molécule d’ARN.  

Transcriptome : L’ensemble des transcrits (ARN) d’une cellule ou d’un organisme.

 Transgène : Gène d’un organisme « donneur » introduit dans un organisme « receveur » ; ce dernier est alors dit transgénique.  

Transgenèse : Ensemble des processus qui permettent de fabriquer un organisme transgénique.

Unicellulaire (organisme) : Organisme constitué d’une seule cellule (c’est le cas de certains microbes comme les bactéries, les levures).